Zones humides de plaine
Dans notre département, les zones humides de plaine sont essentiellement constituées de marais alcalins. Cependant, sur les plateaux recouverts de placage morainique, se rencontrent des milieux acidifiés relevant des tourbières de transition. S'y ajoutent les prairies humides, les annexes hydrauliques des corridors alluviaux (bras morts, ruisseaux phréatiques…), les étangs de gravières, les rives des lacs et quelques milieux ponctuels (suintements tufeux, sourcins…).
Ces milieux sont très fortement menacés : altération de la qualité des eaux, endiguements, rectification des lits, drainage, comblement, captages, aménagements de loisirs (artificialisation des berges, recreusement des marais…), introduction passive ou active d'espèces exotiques envahissantes font partie des contraintes généralement bien identifiées.
Plus insidieux, l'abandon des pratiques agricoles traditionnelles (fauche ou pâturage) semble aujourd'hui devenir un facteur déterminant de raréfaction de certains habitats humides.
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Oeillet de Monptellier (Dianthus monspessulanus)
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Sagine noueuse (Sagina nodosa)
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Silène fleur de coucou (Silene flos-cuculi)
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Achillée sternutatoire (Achillea ptarmica)
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Aster fausse pâquerette (Aster bellidiastrum)
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Bident penché (Bidens cernua)
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Bident à feuilles tripartites (Bidens tripartita)
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Bident feuillé (Bidens frondosa)
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Prêle des champs (Equisetum arvense)
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Prêle des eaux courantes (Equisetum fluviatile)
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Prêle d'hiver (Equisetum hyemale)
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Prêle des marais (Equisetum palustre)
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Fougère des Chartreux (Dryopteris carthusiana)
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Dryoptéris à crêtes (Dryopteris cristata)
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Thelyptéris des marais (Thelypteris palustris)
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Flûteau lancéolé (Alisma lanceolatum)
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Plantain d'eau (Alisma plantago-aquatica)
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Blysmus comprimé (Blysmus compressus)
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Scirpe maritime (Bolboschoenus maritimus)
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Laîche grêle (Carex acuta)
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Laîche des marais (Carex acutiformis)
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Laîche paradoxale (Carex appropinquata)
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Laîche de Davall (Carex davalliana)
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Laîche à tiges arrondies (Carex driandra)
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Laîche dioïque (Carex dioica)
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Laîche à épis distants (Carex distans)
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Laîche distique (Carex disticha)
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Laîche hérisson (Carex echinata)
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Laîche élevée (Carex elata)
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Laîche allongée (Carex elongata)
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Laîche jaune (Carex flava subsp. flava)
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Laîche à inflorescences écailleuses (Carex viridula subsp. brachyrrhyncha)
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Laîche à tiges basses (Carex viridula subsp. oedocarpa)
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Laîche hérissée (Carex hirta)
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Laîche de Host (Carex hostiana)
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Laîche à utricules velus (Carex lasiocarpa)
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Laîche des bourbiers (Carex limosa)
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Laîche pâle (Carex pallescens)
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Laîche paniculée (Carex paniculata)
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Laîche faux souchet (Carex pseudocyperus)
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Laîche puce (Carex pulicaris)
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Laîche des rives (Carex riparia)
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Laîche à utricules renflés en vessie (Carex vesicaria)
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Laîche des renards (Carex vulpina)
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Fausse laîche des renards (Carex vulpinoidea)
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Marisque (Cladium mariscus)
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Souchet allongé (Cyperus longus)
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Héléocharis épingle (Eleocharis acicularis)
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Héléocharis d'Autriche (Eleocharis austriaca)
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Héléocharis des marais (Eleocharis palustris)
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Scirpe à une écaille (Eleocharis uniglumis)
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Linaigrette grêle (Eriophorum gracile)
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Rhynchospora blanc (Rhynchospora alba)
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Jonc des tonneliers (Schoenoplectus lacustris)
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Scirpe de Tabernaemontanus (Schoenoplectus tabernaemontani)
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Scirpe du littoral (Schoenoplectus littoralis )
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Scirpe mucroné (Schoenoplectus mucronatus)
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Scirpe à tiges trigones (Schoenoplectus triqueter )
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Scirpe jonc (Scirpoides holoschoenus)
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Choin noirâtre (Schoenus nigricans)
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Scirpe des bois (Scirpus sylvaticus)
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Lentille d'eau gibbeuse (Lemna gibba)
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Spirodèle à plusieurs racines (Spirodela polyrhiza)
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Millepertuis de Désétang (Hypericum desetangsii)
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Lycope d'Europe (Lycopus europeaus)
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Menthe aquatique (Mentha aquatica)
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Menthe des champs (Mentha arvensis)
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Menthe à longues feuilles (Mentha longifolia)
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Epiaire des marais (Stachys palustris)
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Lotier glabre (Lotus glaber)
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Lotier pédonculé (Lotus pedunculatus)
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Lotier maritime (Lotus maritimus)
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Lythrum salicaire (Lythrum salicaria )
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Ludwigie des marais (Ludwigia palustris)
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Lysimaque vulgaire (Lysimachia vulgaris)
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Samole de Valerand (Samolus valerandi )
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Renoncule scélérate (Ranunculus sceleratus)
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Reine des prés (Filipendula ulmaria)
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Gaillet allongé (Galium palustre L. subsp. elongatum)
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Gaillet des marais (Galium palustre L. subsp. palustre)
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Gaillet aquatique (Galium uliginosum)
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Saule des vanniers (Salix viminalis)
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Véronique à écussons (Veronica scutellata)
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Angélique des bois (Angelica sylvestris)
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Oenanthe fistuleuse (Oenanthe fistulosa)
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Oenanthe à feuilles de peucédan (Oenanthe peucedanifolia)
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Peucédan palustre (Peucedanum palustre)
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Sélin à feuilles de cumin (Selinum carvifolium)
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Fenouil des chevaux (Silaum silaus)
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Cirse de Monptellier (Cirisum monspessulanum)
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Cirse faux épinard (Cirsium oleraceum)
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Cirse des marais (Cirsium palustre)
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Cirse tubéreux (Cirsium tuberosum)
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Eupatoire à feuilles de chanvre (Eupatorium cannabinum)
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Agrostide des chiens (Agrostis canina)
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Vulpin genouillé (Alopecurus geniculatus)
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Calamagrostide blanchâtre (Calamagrostis canescens)
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Fétuque à feuilles rondes (Festuca stricta Host subsp. trachyphylla)
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Fétuque à feuilles capillaires (Festuca trichophylla (Gaudin) K. Richter subsp. trichophylla)
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Gaudinie fragile (Gaudinia fragilis)
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Glycérie plissée (Glyceria notata)
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Glycérie flottante (Glyceria fluitans)
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Leersie faux riz (Leersia oryzoides)
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Molinie bleue (Molinia caerulea)
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Alpiste roseau (Phalaris arundinacea)
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Roseau commun (Phragmites australis)
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Pâturin des marais (Poa palustris)
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Pâturin de Jordan (Poa pratensis L. subsp. jordanii)
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Glaïeul des marais (Gladiolus palustris)
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Iris des marais (Iris pseudoacorus)
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Jonc à fleurs aigues (Juncus acutiflorus)
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Jonc des Alpes fuscoater (Juncus alpinoarticulatus Chaix subsp. fuscoater)
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Jonc articulé (Juncus articulatus)
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Jonc des crapauds (Juncus bufonius)
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Jonc bulbeux (Juncus bulbosus)
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Jonc aggloméré (Juncus conglomeratus)
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Jonc étalé (Juncus effusus )
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Jonc glauque (Juncus inflexus)
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Jonc noueux (Juncus subnodulosus)
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Troscart des marais (Triglochin palustris)
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Inule de Suisse (Inula helvetica)
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Inule à feuilles de saule (Inula salicina)
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Liondent à longues tiges (Leontodon hispidus L. subsp. hastilis)
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Pétasite hybride (Petasites hybridus)
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Pulicaire disentérique (Pulicaria dysenterica)
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Pulicaire commune (Pulicaria vulgaris)
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Scorsonère humble (Scorzonera humilis)
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Séneçon aquatique (Senecio aquaticus )
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Séneçon erratique (Senecio erraticus)
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Séneçon des marais (Senecio paludosus)
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Laiteron des marécages (Sonchus arvensis L. subsp. uliginosus)
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Liseron des haies (Calystegia sepium)
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Cardamine amère (Cardamine amara)
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Cardamine de Matthiole (Cardamine pratensis L. subsp. matthioli)
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Cardamine dentée (Cardamine pratensis L. subsp. dentata)
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Cresson amphibie (Rorippa amphibia)
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Cresson des fontaines (Nasturtium officinale)
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Succise des prés (Succisa pratensis)
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Rossolis à feuilles longues (Drosera longifolia)
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Gentiane pneumonanthe (Gentiana pneumonanthe)
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Géranium des marais (Geranium palustre)
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Millepertuis à quatre ailes (Hypericum tetrapterum)
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Scutellaire à casque (Scutellaria galericulata)
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Scutellaire mineure (Scutellaria minor)
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Germandrée d'eau (Teucrium scordium)
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Gesse des marais (Lathyrus palustris)
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Grassette vulgaire (Pinguicula vulgaris)
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Petit utriculaire (Utricularia minor)
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Utriculaire de Bremi (Utricularia bremii)
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Epilobe des marais (Epilobium palustre)
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Epilobe à petites fleurs (Epilobium parviflorum)
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Polygale amer (Polygala amarella)
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Rumex géant (Rumex hydrolapathum)
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Rumex maritime (Rumex maritimus)
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Populage des marais (Caltha palustris)
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Renoncule flammette (Ranunculus flammula)
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Renoncule langue (Ranunculus lingua)
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Pigamon jaune (Thalictrum flavum)
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Pigamon simple (Thalictrum simplex)
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Bourdaine (Frangula alnus)
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Potentille des marais (Potentilla palustris)
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Pimprenelle officinale (Sanguisorba officinalis)
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Bident penché (Bidens cernua )
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Gnaphale blanc jaunâtre (Pseudognaphalium luteoalbum )
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Fritillaire pintade (Fritallaria meleagris)
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Orchis incarnat (Dactylorhiza incarnata)
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Orchis jaune pâle (Dactylorhiza ochroleuca)
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Orchis de mai (Dactylorhiza majalis)
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Orchis de Traunsteiner (Dactylorhiza traunsteineri)
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Epipactis des marais (Epipactis palustris)
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Orchis moustique (Gymnadenia conopsea)
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Orchis odorant (Gymnadenia odoratissima)
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Liparis de Loesel (Liparis loeselii)
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Listère à feuilles ovales (Listera ovata)
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Orchis à fleurs lâches (Anacamptis laxiflora)
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Orchis des marais (Anacamptis palustris)
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Spiranthe d'été (Spiranthes aestivalis)
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Massette à larges feuilles (Typha latifolia)
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Massette de Shuttleworth (Typha shuttleworthii)
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Impatiente glanduleuse (Impatiens glandulifera)
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Aulne glutineux (Alnus glutinosa)
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Myosotis gazonnant (Myosotis laxa subsp. caespitosa)
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Myosotis des marais (Myosotis scorpioides)
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Myosotis de Rehsteiner (Myosotis rhesteineri)
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Consoude officinale (Symphytum officinale)
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Saule à oreillettes (Salix aurita )
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Saule cendré (Salix cinerea)
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Saule rampant (Salix repens)
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Parnassie des marais (Parnassia palustris)
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Gratiole officinale (Gratiola officinalis)
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Pédiculaire des marais (Pedicularis palustris)
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Pédiculaire des forêts (Pedicularis sylvatica)
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Scrophulaire auriculée (Scrophularia auriculata)
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Scrophulaire des ombrages (Scrophularia umbrosa)
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Véronique mouron d'eau (Veronica anagillis-aquatica L. subsp. anagillis-aquatica)
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Véronique en chaîne (Veronica anagallis-aquatica L. subsp. aquatica)
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Véronique beccabunga (Veronica beccabunga)
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Ache rampante (Apium repens)
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Hydrocotyle commun (Hydrocotyle vulgaris)
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Laser de Prusse (Laserpitium prutenicum)
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Oenanthe de Lachenal (Oenanthe lachenalii)
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Valériane dioïque (Valeriana dioica)
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Valériane officinale (Valeriana officinalis)
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Valériane des prés (Valeriana pratensis )
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Valériane rampante (Valeriana repens)
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Violette naine (Viola pumila)
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Liparis de Loesel (Liparis loeselii)
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Linaigrette grêle (Eriophorum gracile)
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Orchis à tête blanche (Dactylorhiza ochroleuca )
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Gentiane pneumonanthe (Gentiana pneumonanthe )
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Glaïeul des marais (Gladiolus palustris )
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Polystic à crêtes (Dryopteris cristata )
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Laîche de Buxbaum (Carex buxbaumi )
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Gratiole officinale (Gratiola officinalis )
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Rhynchospore blanc (Rhynchospora alba )